درود
با تمام نسخه های php و apache mpm تست شد و هیچ کدوم کار نکرد.
با یکی از پشتیبان های دایرکت ادمین مشکل رو مطرح کردم و تائید شد که ورژن 1283 کاستوم بیلد برای nginx+apache همراه با ioncube 4.7.5 مشکل داره.
برای درک بهتر این معضل اسکریپت کاستوم بیلد رو به آخرین نسخه آپدیت کنید و سپس تمام پکیجها رو آپدیت کنید ، مشاهده میکنید که لودر ioncube عمل نمیکنه و whmcs کار نمیکنه!