درود
فعلا دستور زیر را بزنید
cp -f /usr/share/mysql/my-large.cnf /etc/my.cnf

و سپس y...

و سپس MYSQL رو ریستارت کنید
مشکلتون حل میشه
بعدا متناسب با کاربرد کانفیگ خود را انجام دهید