با يه ادمين سرور كه تخصصش كانفيگ آپاچي و ماي اس كيو ال هست بايد صحبت كنيد كه تنظيمات رو براتون سفارشي كنه يا كلا مشكلتون رو حل كنه.
اگه اعلام كنيد حاضريد هزينه كنيد فكر كنم متخصص ها بيان و اعلام آمادگي كنن.
معمولا با سرچ تو گوگل هم شايد به جوابايي رسيديد...

اينجا هم يه مقاله هست:
MySQL Blog:: MySQL 5 Optimization and Tuning Guide