بله همانطور که دوستان گفتند مشکل هارد هست
سرور را ببرید در حالت rescue mode و تست هارد بگیرید شاید کلا مشکل دار شده هاردتان
از قسمت performance هم لاتنسی هارد را مانیتور کنید ببینید روی کدام هارد بالا هست و بعد VM را پیدا کنید و پیشگیری کنید.