تا اونجایی که من ایشون رو میشناسم میدونم علاقه شدیدی به سی پنل دارند ، فکر نکنم دایرکت استفاده کردند رو سرورشون
در سی پنل مسیر فرقی نمیکنه ولی در دایرکت ادمین
cgi باشه
/usr/local/lib/php.ini
و اگر suphp بزنید
مسیر به
/usr/local/etc/php5/cgi/php.ini
بهترین راه برای ویرایش php.ini بنظر بنده از طریق خود کنترل پنل هست و دایرکت ادمین از طریق ssh