درود
دوست گرامی اگر امنیت هاستتون و سروری که روش هستید در حد مناسبی باشد هکر کار خاصی نمیتواند بکند
مطمئنا باگ و مشکلی در سرور و یا دسترسی های سایت شما میباشد که هکر براحتی شل را آپلود می نماید
توجه کنید مهمتر از امنیت اسکریپت شما امنیت سرور اصلی هستش که اهمیت دارد