بهترین روش این هست فایل های home را انتقال بدید و بعد از mysql بک آپ بگیرید.و بک آپ را انتقال بدید.
MYSQL حجم زیادی داره و ممکن هست با سیستم دوم همخونی نداشته باشه.
بکک آپش حجم خیلی کمی داره