شما اقدام به نصب کرنل 2.6.35.13 کردید که یه سری مراحل خاص داره مثلا ساخت initramfs و ...
شما باید پچ میکردید نه کامپایل دوباره آموزش پچ کردن رو در فیلمی جداگانه بهتون خواهم داد
بنده از Linux CentOS 6.3 استفاده کردم و زمانی که شما grub.conf یا menu.lst رو ویرایش کردید نیازی به اجرای دستور grub-update ندارید فقط ریبوت کنید .