اگه هدفتون اینه که هیچ اطلاعاتی از عملکرد اجرای قبلی در ریجیستری سیستم نماند که در اینصورت همون نسخه پرتابل کفایت میکنه به شرطی که نسخه پرتابلی باشه که فولدر تنظیمات اجرای قبلی را تو همون پوشه برنامه بسازه که هربار که خواستین فایل exe را اجرا کنید کافیه پوشه تنظیمات قبلی را دیلیت کنید تا یه نسخه خام اجرا بشه. که برای این منظور میتونید از نرم افزار WMware Thinapp استفاده کنید. تو این نرم افزار وقتی به مرحله کپچر نرم افزار خودت رسیدی، فقط نرم افزارو باز کن و ببند یا اگه تنظیمات خاصی هم داره اعمال کن و بعد برنامه را ببند و برو مراحل بعد و گزینه پرتابل usb را انتخاب کن و خروجی بگیر. این برای رفع محدودیتهای ریجیستری اکثر نرم افزارها خوبه. یا بدین یه برنامه نویس یه برنامه بنویسه که بعد از بستن نرم افزارتون، اونو اجرا کنید تا مسیرها و ریجیستری را حذف کنه.
یا تو ویندوز یوزر بزن و دسترسی ادمین بده و روی اون اجرا کن